Sisu
Peamised erinevused meeste ja naiste vahel on X- ja Y-kromosoomid. Inimeste seas teevad kaks X-kromosoomi naise ning X- ja Y-kromosoom mehe. Nende kromosoomide vahel on aga ka teisi eristavaid tunnuseid. Mõned erinevused hõlmavad suurust, geenide arvu ja isegi ebanormaalseid kromosoomipaare. Mõnede liikide loomadel on erinev sugu määrav süsteem, kuna nad kasutavad Z- ja W-kromosoomi.
Töötavad geenid
Kuigi meessoost Y- ja naissoost X-kromosoom erinevad suuruse poolest, erinevad nad ka kromosoomis töötavate geenide arvust. X-kromosoom sisaldab rohkem kui 1000 töötavat geeni ja Y-kromosoom sisaldab vähem kui 100 töötavat geeni. Ehkki meestel on X-kromosoom, käitub see teise X-kromosoomi korral väga erinevalt, võrreldes Y-kromosoomi käitumisega. X-kromosoomi töötavatest geenidest on soo jaoks ainulaadsed 200–300, seega on töötavatest geenidest vaid 700–800 jagatud ja aktiivsed nii meestel kui naistel.
Suurus
Kromosoomide tegelik suurus erineb meestel ja naistel. Lammaste kromosoomide uurimisel leiti, et meestel oli mitu kromosoomipaari suurem kui naistel. Kromosoomide suuruse erinevused võivad olla võtmeks sooliste erinevuste selgitamisel, mida X või Y kromosoom ei seleta.
Temperatuur
Mõnel liigil, näiteks sisalikel, koidel, lindudel ja lameussidel, on soo määramise geenid erinevad kui X ja Y. Need geenid on Z ja W. ZZ genotüüp tekitab isaseid ja ZW emasloomi. Mõnede nende liikide soo määramist juhib temperatuur. On teada, et kõrge temperatuur määrab looma soo. Näiteks aligaatorimunade kõrge inkubatsioonitemperatuur soodustab isaste, ZZ, genotüüpide teket. Kuid paljudes sisalikes ja kilpkonnades eelistatakse kõrgeid inkubatsioonitempe emaslooma, ZW, genotüüpi.
Seksuaalsed kõrvalekalded
On mitmeid sündroome, mis loovad soo eristamise kõrvalekaldeid. Ainult X-kromosoomi omavatel naistel on Turneri sündroom ja kui tüdruk sünnib, elab ta ebanormaalset kasvu ning on väga väike, kaelal on täiendavad nahavoldid. Kolmekordne X sündroom ilmneb naistel, kellel on täiendav X-kromosoom. Neid tuntakse kui supernaisi ja nad kipuvad olema sarnased kahe X-kromosoomiga emasloomadele. Kahe X- ja Y-kromosoomiga sündinud meestel on Klinefelteri sündroom. Need mehed on tavaliselt väga naiselikud ja neil võib olla isegi kõrge hääl. XYY sündroom ilmneb siis, kui meestel on ekstra Y-kromosoom. Neid tuntakse supermeestena ja nad tekitavad tavaliselt palju rohkem testosterooni kui tüüpilised mehed.