Sisu
- DNA eksperimendi PCR analüüs
- Kas me sööme geneetiliselt muundatud papaiat?
- GMOde ja DNA ekstraheerimise testimine
- DNA kontsentratsioon taimedes
Geneetiliselt muundatud organismid (GMOd) on vaieldav teema. Pooldajad väidavad, et GMOd muudavad toidu kasvatamise viisi revolutsiooniliselt ja aitavad vähendada vaesust kogu maailmas.Oponentide arvates on GMOd ohtlikud mitte ainult inimtoiduks, vaid nende mõju GMO-põldude läheduses olevatele geneetiliselt muundamata põllukultuuridele on laastav. Lisaks väidavad detraktorid, et suuri GMO-ettevõtteid ei huvita mitte inimeste tervis, vaid kasumid. GMO argument on siin selleks, et jääda; GMO tooted täidavad supermarketite riiulid. GMO eksperimendid sobivad teaduse tudengitele kõigil tasanditel; GMO on ja jääb ka edaspidi nende elu osaks.
DNA eksperimendi PCR analüüs
BioBusi haridusprogrammid lõid selle katse keskkooli loodusteaduste õppuritele. See hõlmab kahte erinevat etappi. Esimeses uuringus osalevad õpilased laboratooriumieelses elektroonilises PCR-is (polümeraasi ahelreaktsioon), mille käigus nad kasutavad veebipõhist programmi BLAST (Basic Local Alignment Search Tool), et luua praimerjärjestused, mida kasutati tegeliku laborikatse ajal. Esimene samm aitab õpilastel paremini mõista PCR-reaktsiooni üldisi mõisteid ja tuvastada nende PCR-praimeritega võimendatud DNA järjestus. Teine etapp võtab vähemalt kaks päeva, seega on vajalik piisav klassiaeg. Õpilased viivad sojavalguga läbi oma PCR-eksperimendi. Need etapid hõlmavad DNA eraldamist sojavalgust, PCR-reaktsiooni seadmist, ahelate amplifitseerimist ja jälgimist.
Kas me sööme geneetiliselt muundatud papaiat?
Alates 2011. aastast ei ole Ameerika Ühendriikides GMO-toodete märgistamisnõudeid. Niisiis, õpilaste jaoks sobiv katse on erinevate toitude katsetamine, et näha, kas need on tõepoolest GMOd. Katsetes imporditi Havai papaia seemneid, ehkki võite kasutada mis tahes papaiat. Projekt sobib keskmise kooliealistele ja vanematele lastele. Õpilane saab uurida suvalist arvu seemneid, seda rohkem, seda parem, kuid katse pikkus sõltub tegelikult lubatud klassiajast. Õpilane eemaldab papaia seemned, lõikab need pooleks (ühe papaia seemneid Petri tassi kohta jälgige, milles on GMO seemneid, ja nendes, kus seda pole), rakendab seemnetele X-Gluc ja fosfaatpuhvri soolalahust. Järgmise 24 tunni jooksul on X-Gluc kromogeenne substraat, millel on erinevused GMO-s võrreldes GMO-deta seemnetega.
GMOde ja DNA ekstraheerimise testimine
Mida paremini saab tudeng või teadlane DNA ekstraheerida konkreetsest tootest, seda paremaid katseid nad saavad läbi viia. DNA ekstraheerimise katses kasutatakse erinevaid kodumajapidamises kasutatavaid pesemisvahendeid, et näha, milline konkreetne toode ekstraheerib hernestest kõige rohkem DNA-d. Õpilane võib kasutada mis tahes tavalist puhastusvahendit, kuid kõige parem on seda teha puhastusvahenditega, millel on erinevad keemilised ühendid, näiteks puhastusvahend X-14, Ultra Joy ja teised erineva tugevusega. Segage herned soola ja sooja veega. Rakumaterjal kurnatakse välja, lisage DNA puhastamiseks kaks tl puhastusvahendit, üks supilusikatäis alkoholi ja reaktiivne ensüüm. Laske lahusel seista umbes 24 tundi, jälgige ja laske õpilasel oma tulemused üles märkida.
DNA kontsentratsioon taimedes
Erinevad taimeosad annavad oma rakustruktuuri tõttu rohkem DNA proove kui teised. Selle katse eesmärk on katsetada, milline taime osa annab üliõpilasuurijale kõige rohkem DNA ahelaid, millega nad saavad hiljem koos töötada. Katse jaoks on vaja kasutada mitmeid materjale, sealhulgas pliidiplaat, segisti, termomeeter, jäämahuti, 95-protsendiline etanoolialkohol, vedel nõudepesuvahend, kaitseplastikindad, taimne materjal (eraldatud taime eri osadeks) ja palju muud. Taimne materjal segatakse, eraldatakse, jahutatakse ja segatakse 24 tunni jooksul DNA ekstraheerimise ainetega. Katse sobib kõige paremini keskkooliõpilastele etappide keerukuse ja vaatluse vajaliku detaili tõttu. Projekti lõppedes on õpilasel parem arusaam parimatest taimeosadest, mida saab DNA ekstraheerimiseks kasutada, mis võimaldab tal tõhusamalt teha edasist tööd GMOde ja muude taimepõhiste uuringute osas.