Sisu
Alustage tundmatute bakterite tuvastamist, jälgides nende füüsikalisi omadusi, näiteks raku seina, kuju ja sidemeid. Identifitseerimise edasiseks kitsendamiseks kasutage standardset laboratoorset protseduuri, näiteks rakkude värvimist, kultiveerimist ja DNA järjestamist. Bakterid jaotatakse liikidesse üldjuhul nende füüsikaliste ja metaboolsete omaduste, mitte geneetiliste suhete alusel.
Positiivne või negatiivne
Eubakterid on nn tõelised bakterid.Neid eristatakse arhaeadest või arhebakteritest, mis moodustavad eraldi kuningriigi. Eubakterid on prokarüootid, mis tähendab, et neil puudub tuumamembraan. Enamikul on rakumembraanid ja rakuseinad. Paksude rakuseintega baktereid nimetatakse gram-positiivseteks, kuna nad on vastuvõtlikud surma ajal, mida nimetatakse Grami peitsiks, surma. Grami peits on esimene test, mida kasutatakse bakterite klassifitseerimisel. Õhukeste või puuduvate rakuseintega bakterid on gramnegatiivsed, kuna need ei jäta Grami peitsvärvi lõksu.
Bakterite moodustamine
Sfäärilisi baktereid nimetatakse coccideks, sirgeid vardaid moodustavaid baktereid nimetatakse batsillideks ja keskmise kujuga baktereid nimetatakse coccobacillideks. Need kõik võivad olla gram-negatiivsed või gram-positiivsed. Jäikaid, spiraalse kujuga baktereid nimetatakse spirillaks ja need on ainult gram-negatiivsed. Painduvaid, sõltumatult liikuvaid, spiraalse kujuga baktereid nimetatakse spiroketideks ja grammneutraalsed. Lõpuks nimetatakse jäikaid, komakujulisi vardaid vibrideks ja gramnegatiivseks. Mõnel vähetuntud ja halvasti mõistetaval bakteril on erinev kuju, näiteks tähekujulistel stella- ja kirvekujulistel labridel. Samuti on kaks vahepealset bakterirühma. Riketsiad on sarnased viirustega, neil on mitmesugune kuju, gramnegatiivsed ja suudavad ellu jääda ainult teiste rakkude sees. Mükoplasmas, mis on seentega sarnane, puuduvad rakuseinad ja sisaldavad paljusid liigispetsiifilisi, kopsupõletikku põhjustavaid kopsupatogeene.
Kuubid, kobarad ja muud sidemed
Cocci ja batsilli klassifitseeritakse täiendavalt sidemete järgi, mille nad pärast rakkude jagunemist moodustavad. Diplokokid ja diplobatsillid kleepuvad paarikaupa kokku. Streptokokid ja streptobatsillid moodustavad ahelaid. Tetradi kokad püsivad nelja bakteri ruutudes. Sarcinae cocci moodustavad kaheksa bakteri kuubikud ja stafülokokid moodustavad klastrid.
Bakteri tuvastamine
Kui teil on tundmatu bakter ja soovite seda tuvastada, peate tavaliselt tegema grammi peitsi ja seejärel jälgima koloonia välimust ja individuaalseid iseärasusi. Sel hetkel võite öelda, et teil on näiteks gram-negatiivne, aeroobne streptobatsill. Seejärel saate oma proovi võrrelda erinevate teadaolevate bakteritega, asetades selle erinevatele söötmetele, mis soodustavad mõnede liikide kasvu ja pärsivad teisi, või katsetades proovi erinevate teadaolevate bakteriaalsete kõrvalsaadustega. Lõpliku abinõuna saab DNA järjestamise abil kindlaks teha, kas teil on teadaolevaid või tundmatuid bakteri liike või tüvesid, tingimusel et võrdlete neid liikide või tüvedega, mille genoom on juba sekveneeritud.